2024-11-15 02:07:07
BstDNAPolymerase,LargeFragment(嗜熱脂肪芽孢桿菌DNA聚合酶大片段)是一種經(jīng)過改造的酶,它來源于嗜熱脂肪芽孢桿菌(Bacillusstearothermophilus)DNA聚合酶I,通過重組技術(shù)在大腸桿菌中表達(dá)并純化獲得。這種酶具有5'→3'的DNA聚合酶活性,但不具有5'→3'的核酸外切酶活性,因此它在等溫擴增反應(yīng)中非常有用,如環(huán)介導(dǎo)的等溫擴增(LAMP)和滾環(huán)擴增(RCA)等。以下是BstDNAPolymerase,LargeFragment的一些關(guān)鍵特點和應(yīng)用:1.**等溫擴增**:BstDNAPolymerase,LargeFragment具有很強的鏈置換能力,適用于多種等溫擴增反應(yīng),這些反應(yīng)通常在50-68°C之間進(jìn)行,比較好反應(yīng)溫度為65°C。2.**快速測序**:由于其高聚合酶活性,BstDNAPolymerase,LargeFragment可以用于快速測序,特別是對于高GC含量的DNA模板或微量(納克量級)DNA模板的測序。3.**全基因組擴增**:BstDNAPolymerase,LargeFragment也可用于全基因組擴增(WGA),這是一種在不需要熱循環(huán)儀的情況下擴增整個基因組DNA的技術(shù)。4.**高dUTP耐受性**:與BstDNAPolymerase2.0相比,BstDNAPolymerase,LargeFragment在進(jìn)行等溫擴增時不具有將dUTP摻入合成的DNA鏈的能力,這使得它在某些應(yīng)用中更具優(yōu)勢。泛素連接酶E3識別特定的靶蛋白,并促進(jìn)E2上的泛素轉(zhuǎn)移到靶蛋白的賴氨酸殘基上,形成泛素化標(biāo)記。Recombinant Human RANKL/TNFSF11/CD254 Protein
牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I(VacciniaVirusDNATopoisomeraseI)與細(xì)菌DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶的主要區(qū)別如下:1.**來源不同**:-牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I來源于牛痘病毒,是一種真核生物病毒中的酶。-細(xì)菌DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶則來源于原核生物,如大腸桿菌的ω蛋白等。2.**功能特性**:-牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I能夠解旋DNA的超螺旋結(jié)構(gòu),并且識別并切割雙鏈DNA末端[5’C(T)CCTT],與DNA形成共價連接形成穩(wěn)定復(fù)合物,遇到DNA的5’-OH基團后,重新連接形成完整DNA鏈。-細(xì)菌DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶,如大腸桿菌的ω蛋白,主要功能是催化DNA鏈斷開和結(jié)合的偶聯(lián)反應(yīng),以改變DNA的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)。3.**活性條件**:-牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I即使在Mg2+不存在的條件下也顯示活性。-細(xì)菌DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶可能需要Mg2+等金屬離子作為輔因子來發(fā)揮活性。4.**作用的DNA鏈**:-牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I能使正負(fù)兩方的超螺旋分子均形成松散型。-原核生物由來的DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I只作用負(fù)鏈的超螺旋分子。5.**共價鍵形成**:-牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I與DNA形成共價連接,此酯鍵中所貯存的能量可能在切斷端的再結(jié)合上起著作用。-細(xì)菌DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶在原核生物中是游離型的5′-OH末端扣3′-磷酸末端與酶形成共價鍵。
Recombinant Human LRIG1 Protein,His TagHifair? Ⅱ 1st Strand cDNA Synthesis Kit :適用于從總RNA或mRNA模板合成鏈cDNA,具有高熱穩(wěn)定性。
在質(zhì)粒DNA提取過程中,確保DNA的完整性和活性至關(guān)重要,這通常涉及以下幾個關(guān)鍵因素:1.**溫和的裂解條件**:選擇適當(dāng)?shù)牧呀夥椒▽τ诒3諨NA的完整性至關(guān)重要。對于大于15kb的質(zhì)粒DNA,應(yīng)采用溫和的裂解方法,如將細(xì)菌懸浮于等滲的葡萄糖溶液中,加入溶菌酶和EDTA破壞細(xì)胞壁和細(xì)胞膜,以減少對質(zhì)粒DNA的機械剪切力,從而保護其完整性。2.**避免過度裂解**:在質(zhì)粒提取過程中,并非裂解時間越長越好。過長的裂解時間可能會造成基因組DNA片段的污染,影響質(zhì)粒的純度。3.**適當(dāng)?shù)南礈旌拖疵?*:在純化過程中,適當(dāng)?shù)南礈炜梢匀コ鞍踪|(zhì)和其他雜質(zhì),但過度洗滌可能會導(dǎo)致DNA的損失。洗脫步驟中,確保洗脫液完全浸潤柱膜,以保證結(jié)合在柱膜上的質(zhì)粒得以充分洗脫,避免因洗脫體積過小而影響質(zhì)粒得率。4.**避免DNA的降解**:在提取過程中,添加核酸酶抑制劑可以防止DNA被核酸酶降解。同時,避免長時間將DNA暴露在室溫下,以及避免多次凍融循環(huán),這些都有助于保護DNA的完整性。5.**低溫操作**:盡量在低溫條件下進(jìn)行提取操作,以減少核酸酶的活性,從而保護DNA的完整性。
為了確保PCR實驗中BstDNAPolymeraseI的活性比較大化,以下是一些關(guān)鍵的優(yōu)化措施:1.**反應(yīng)緩沖液**:使用適合BstDNAPolymeraseI的反應(yīng)緩沖液,如NEB提供的IsothermalAmplificationBufferIIPack,該緩沖液包含Tris-HCl、(NH4)2SO4、KCl、MgSO4和Tween®20,pH值為8.8,專為等溫擴增設(shè)計。2.**反應(yīng)條件**:BstDNAPolymeraseI的比較好反應(yīng)溫度通常在65°C左右。確保PCR儀能夠精確控制并保持這一溫度,以保證酶的活性和穩(wěn)定性。3.**酶的濃度**:根據(jù)反應(yīng)體系的需要調(diào)整BstDNAPolymeraseI的用量。過多的酶可能導(dǎo)致非特異性擴增,而過少則可能降低擴增效率。通常,一個單位的酶能夠在65°C下,30分鐘內(nèi)將25nmol的dNTP摻入酸不溶性物質(zhì)。4.**Mg2+濃度**:Mg2+是DNA聚合酶活性的關(guān)鍵輔因子。其濃度對PCR反應(yīng)有影響,需要根據(jù)具體情況調(diào)整Mg2+濃度,以獲得比較好的擴增效果。5.**dNTPs濃度**:dNTPs是DNA合成的基礎(chǔ)原料,其濃度約為200-300μM較為適宜。過高會增加非特異性擴增。6.**引物設(shè)計**:設(shè)計特異性引物,通常長度為18-30個堿基,Tm(熔解溫度)相近,以保證同時退火。7.**模板DNA的質(zhì)量和純度**:確保模板DNA無蛋白質(zhì)、RNA和其他雜質(zhì)的污染,這些雜質(zhì)可能會抑制酶的活性。FnCas12a在切割DNA時產(chǎn)生黏性末端,有助于提高同源定向修復(fù)(HDR)的效率。
嗜熱脂肪芽孢桿菌DNA聚合酶I(BstDNAPolymeraseI)和它的大片段(LargeFragment)是兩種在分子生物學(xué)實驗中常用的酶。它們的主要區(qū)別在于結(jié)構(gòu)和活性:1.**結(jié)構(gòu)**:-完整的BstDNAPolymeraseI包含一個5'→3'的核酸外切酶活性區(qū)域,而大片段是通過基因工程改造或蛋白酶處理去掉了這個外切酶活性區(qū)域的酶。因此,大片段沒有5'→3'的核酸外切酶活性,但保留了5'→3'的DNA聚合酶活性。2.**活性**:-BstDNAPolymeraseI具有5'→3'的核酸外切酶活性,這意味著它在合成DNA的同時可以“校對”錯誤,切除不匹配的核苷酸。而大片段由于缺少外切酶活性區(qū)域,不具有這種校對能力。-大片段具有更強的鏈置換能力,這使得它非常適合于等溫擴增反應(yīng),如環(huán)介導(dǎo)的等溫擴增(LAMP)和滾環(huán)擴增(RCA)。3.**應(yīng)用**:-BstDNAPolymeraseI由于具有校對功能,可能更適合于需要高保真度的DNA合成反應(yīng)。-BstDNAPolymerase,LargeFragment由于其鏈置換能力,更適合于等溫擴增技術(shù),這些技術(shù)不需要熱循環(huán)儀,可以在恒定溫度下進(jìn)行DNA擴增。4.**熱穩(wěn)定性**:-BstDNAPolymerase,LargeFragment通常在65°C左右的溫度下進(jìn)行反應(yīng),而BstDNAPolymeraseI可能具有更寬的反應(yīng)溫度范圍。UBE2L3作為泛素化途徑中的關(guān)鍵酶,其在蛋白質(zhì)降解、信號傳導(dǎo)、細(xì)胞周期控制等重要內(nèi)容有著作用。Recombinant Human RANKL/TNFSF11/CD254 Protein
UDG在結(jié)構(gòu)上屬于單功能DNA糖基化酶,它通過沿著DNA鏈滑動,識別尿嘧啶分子,進(jìn)行堿基切除。Recombinant Human RANKL/TNFSF11/CD254 Protein
質(zhì)粒DNA提取后的儲存條件對于保持其活性至關(guān)重要。以下是一些推薦的儲存方法:1.**干燥保存**:質(zhì)粒DNA以干粉狀態(tài)保存是比較好的方法。如果總DNA以溶液形式保存,可以使用1×TE緩沖液稀釋,且TE緩沖液的pH值應(yīng)為8.0-8.5之間。2.**低溫保存**:植物總DNA低溫保存比較好在-80℃以下或液氮保存。如果沒有條件,也可以在-20℃保存。總DNA應(yīng)避免經(jīng)常凍融,同時建議每份樣品保存3-5個樣本??侱NA提取后保存的時限通常較組織要長(>兩年),但若長期保存,每隔兩年應(yīng)抽測,對不符合使用要求的DNA進(jìn)行更新。3.**避免反復(fù)凍融**:反復(fù)凍融會破壞DNA的完整性和活性,因此應(yīng)盡量避免。4.**使用保護劑**:化學(xué)添加劑如二甲基亞砜(DMSO)可以防止DNA單鏈斷裂,但因其毒性和使用量的問題,并不是理想的保護劑。5.**封裝技術(shù)**:通過封裝技術(shù)保存DNA,可以隔絕外界水、氧氣和光等可能影響DNA穩(wěn)定的因素。例如,DNAshell®技術(shù)基于密封的不銹鋼微型膠囊,在惰性氣氛下,給予DNA干粉保護。6.**使用穩(wěn)定劑**:一些天然的雙糖,如海藻糖,被認(rèn)為是一種多功能的保護劑,可以保護生物體免受冷凍、加熱等不利條件的影響。Recombinant Human RANKL/TNFSF11/CD254 Protein